Saat ini Stasiun Plabuan tidak lagi melayani kegiatan angkutan penumpang maupun angkutan barang rutin. Meskipun begitu, sebanyak sembilan puluh enam perjalanan kereta api melintasi stasiun ini setiap harinya.
Stasiun Plabuan juga masih terus dimanfaatkan oleh PT KAI untuk program persusulan antar-kereta. Beberapa kereta api terkadang berhenti menunggu untuk disusul oleh kereta api lain di belakangnya.
Dahulu terdapat satu kereta api penumpang yang dijadwalkan berhenti di stasiun ini pada 2014. Kereta api tersebut adalah KA Pekalongan Ekspres yang melayani rute Semarang Tawang-Pekalongan.
Namun, layanan kereta tersebut dihentikan seiring penambahan jadwal perjalanan Kereta Api Kamandaka dari Semarang. Sejak saat itu stasiun ini tidak lagi melayani perjalanan kereta api penumpang mana pun.
“Selalu ada cerita menarik saat kita naik kereta api. Melewati Stasiun Plabuan adalah salah satu momen yang paling berkesan, di mana eksotisme alam dan sejarah perkeretaapian bersatu di tepi Laut Jawa,” kata Executive Vice President Corporate Secretary KAI Raden Agus Dwinanto Budiadji.
